Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M5A7VMS3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M5A7VMS3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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