Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn3aA2ASI5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn3aA2ASI5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn3aA2ASI5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn3aA2ASI5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn3aA2ASI5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Scn3aA2ASI5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms