Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms