Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef6A2A8M8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms