Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crlf3Q9Z2L7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms