Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mbd3Q9Z2D8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mbd3Q9Z2D8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mbd3Q9Z2D8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms