Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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