Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chaf1aQ9QWF0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Chaf1aQ9QWF0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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