Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms