Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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