Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms