Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhojQ9ER71 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhojQ9ER71 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms