Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms