Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccdc97Q9DBT3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccdc97Q9DBT3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccdc97Q9DBT3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccdc97Q9DBT3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Ccdc97Q9DBT3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccdc97Q9DBT3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccdc97Q9DBT3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccdc97Q9DBT3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc97Q9DBT3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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