Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ttc9bQ9D6E4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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