Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms