Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms