Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms