Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms