Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms