Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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