Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sike1Q9CPR7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sike1Q9CPR7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms