Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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