Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cep41Q99NF3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms