Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ubqln4Q99NB8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubqln4Q99NB8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms