Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl43Q99N89 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms