Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hdac9Q99N13 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hdac9Q99N13 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hdac9Q99N13 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hdac9Q99N13 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hdac9Q99N13 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hdac9Q99N13 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hdac9Q99N13 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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