Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ciao1Q99KN2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ciao1Q99KN2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ciao1Q99KN2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ciao1Q99KN2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ciao1Q99KN2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ciao1Q99KN2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms