Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Higd1bQ99JY6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms