Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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