Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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