Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms