Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms