Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Slc6a20aQ8VDB9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Slc6a20aQ8VDB9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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