Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCL2

Sco2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco2Q8VCL2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sco2Q8VCL2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms