Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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