Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vrk3Q8K3G5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vrk3Q8K3G5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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