Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lrrtm1Q8K377 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm1Q8K377 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrtm1Q8K377 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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