Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms