Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl47Q8K2Y7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl47Q8K2Y7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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