Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Abcf3Q8K268 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Abcf3Q8K268 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Abcf3Q8K268 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Abcf3Q8K268 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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