Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Neurl3Q8CJC5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms