Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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