Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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Atg4aQ8C9S8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Atg4aQ8C9S8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg4aQ8C9S8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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