Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms