Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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FarsaQ8C0C7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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