Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Xcl1-201ENSMUST00000027860 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm38275-201ENSMUST00000193293 1532 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms