Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ctdsp2Q8BX07 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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