Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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