Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms